Κατανόηση και στόχευση νέων μοριακών μεταβολών σε Erdheim-Chester Ασθένεια χωρίς τη μετάλλαξη BRAFV600E

Filip Janku, MD, Ph.D.

Omar Abdel-Wahab, MD

Ο Filip Janku, MD, Ph.D., και ο Omar Abdel-Wahab, MD, έλαβαν επιχορήγηση 50.000 δολαρίων για το έργο τους “Κατανόηση και στόχευση νέων μοριακών αλλαγών στην Erdheim-Chester Ασθένεια χωρίς τη μετάλλαξη BRAFV600E”. Σκοπός αυτής της μελέτης είναι να ανακαλύψει θεραπεύσιμες μεταλλάξεις που βρίσκονται σε ασθενείς με BRAF-αρνητικό ECD και να δοκιμάσει στο εργαστήριο ποιες θεραπείες θα λειτουργήσουν καλύτερα γι’ αυτούς.

Ποσό: USD

Τελική έκθεση

Στο πλαίσιο μιας διεθνούς συνεργασίας μεταξύ των Drs. Janku, Omar Abdel-Wahab και συνεργατών στη Γαλλία, πραγματοποιήθηκε η πρώτη ολοκληρωμένη γονιδιωματική ανάλυση του ECD, η οποία περιελάμβανε τόσο την αλληλούχιση ολόκληρου του γονιδιώματος (WES) σε συνδυασμό με την ανάλυση ολόκληρου του μεταγραφώματος (μέσω RNA-seq). Η προσπάθεια αυτή εντόπισε αρκετές επαναλαμβανόμενες ενεργοποιητικές μεταλλάξεις και συγχωνεύσεις στο ECD και έκτοτε έχει δημοσιευθεί/

Επιπλέον, συνεχίζεται η διεξαγωγή WES, RNA-seq και στοχευμένων γονιδιωματικών αναλύσεων του ECD και των συναφών ιστιοκυττάρων στις κλινικές πρακτικές των ερευνητών. Μέχρι σήμερα, έχουμε εκτελέσει WES σε ~40 ασθενείς του ECD και έχουμε εντοπίσει πρόσθετες στοχευμένες γενετικές μεταβολές που δεν έχουν εντοπιστεί στην παραπάνω δημοσίευση.

Επιπλέον, πραγματοποιήθηκε στοχευμένη αλληλούχιση επόμενης γενιάς (NGS) ή PCR σε αρχειακά δείγματα ιστών και/ή δείγματα DNA ελεύθερων κυττάρων (cf) από το αίμα από 25 ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπεία στο MD Anderson και στο Κέντρο Καρκίνου Moores του UCSD. Τα αρχικά δεδομένα παρουσιάστηκαν στο ετήσιο διεθνές ιατρικό συμπόσιο ECD τον Σεπτέμβριο του 2016. Έκτοτε, το σύνολο δεδομένων επεκτάθηκε ώστε να συμπεριλάβει δείγματα από 9 ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπεία στο Κέντρο Καρκίνου Memorial Sloan Kettering (Dr. Eli Diamond) και 2 επιπλέον ασθενείς από το MD Anderson.